Δεν έχουν μακρά παράδοση στις μεταξύ τους αναμετρήσεις ο Παναθηναϊκός με την Κέρκυρα καθώς η νησιωτική ομάδα προβιβάστηκε στην Α’ Εθνική για πρώτη φορά το 2005 και εφέτος διανύει μόλις την έκτη της σεζόν στη μεγάλη κατηγορία.
Πάντως αν και συγκαταλέγεται στις μικρομεσαίες ομάδες που παλεύουν για την παραμονή τους, έχει προκαλέσει αρκετά προβλήματα στον Παναθηναϊκό που σε πέντε επισκέψεις στο νησί των Φαιάκων έχει υποστεί τρεις βαθμολογικές απώλειες, ενώ έχει νικήσει μόλις δύο φορές και μάλιστα σερί με το ίδιο σκορ: 2-0 το 2011 και το 2012 με γκολ του Σισέ (2) και των Λέτο, Νίνη, αντιστοίχως.
Οι δυο πρώτες επισκέψεις των Πρασίνων στην Κέρκυρα ήταν απογοητευτικές καθώς ηττήθηκαν 2-0 το 2005 και 3-1 το 2007 στέλνοντας κόσμο στο αεροδρόμιο για την όχι και τόσο «ζεστή» υποδοχή της αποστολής, ενώ η τελευταία μεταξύ τους εκτός έδρας αναμέτρηση το 2013 έληξε ισόπαλη (0-0).
Ο μόνος παίκτης που έχει ξεχωρίσει στα έντεκα ματς του Παναθηναϊκού με την Κέρκυρα είναι ο Τζιμπρίλ Σισέ που πρόλαβε να πετύχει τρία γκολ, ενώ δύο γκολ έχει για τους Φαίακες ο Γκουέλα.
Η παράδοση στην Κέρκυρα
2005 Κέρκυρα-ΠΑΟ 2-0
2007 Κέρκυρα-ΠΑΟ 3-1
2011 Κέρκυρα-ΠΑΟ 0-2
2012 Κέρκυρα-ΠΑΟ 0-2
2013 Κέρκυρα-ΠΑΟ 0-0